熊本電鉄の電車は、上熊本〜北熊本〜御代志と、藤崎宮前〜北熊本〜御代志の2系統で運行しています。乗り換えの際の料金は、2本目でまとめて支払えます(1本目の整理券がそのまま使えます)。ただし、To熊カードやさくらカードは使えませんので、注意してください。整理券は乗車時に、バスと同じように入手できますが、藤崎宮前駅では、ホームに入る際に発行機から入手してください。また、9：00〜15：30までは、自転車を車内に持ち込むことが可能です。
詳細は、熊本電鉄北熊本駅（096-343-2552）、藤崎宮前駅（096-343-5035）などにお問い合わせ頂くか、熊本電鉄公認ページをご覧下さい。
ここでは、藤崎宮前駅・御代志駅の運行時刻をご紹介します。（古くなっている場合があります。）

※赤字は北熊本止め
　（　　　）は北熊本での上熊本方面接続列車なし
　（赤字）は北熊本止めで、なおかつ、上熊本方面への接続列車なし